Το Σωματείο «Κέντρο Ειδικών Παιδιών – ο Άγιος Σπυρίδων» Ηρακλείου Κρήτης, έχει Διοικητική Αυτοτέλεια. Είναι:
- Νομικό Πρόσωπο Ιδιωτικού Δικαίου
- Ειδικώς Αναγνωρισμένο ως Φιλανθρωπικό Σωματείο, Μη Κερδοσκοπικού Χαρακτήρα
- Πιστοποιημένος Φορέας παροχής Πρωτοβάθμιας Κοινωνικής Φροντίδας
Σκοπός του Σωματείου, είναι η διάγνωση, ειδική αγωγή, εκπαίδευση, ψυχοκοινωνική στήριξη ατόμου και οικογένειας, επαγγελματική και κοινωνική προώθηση – αποκατάσταση του ΑμεΑ με νοητική υστέρηση, μέσω των τομέων και υπηρεσιών που για το σκοπό αυτό, υλοποιεί.
Το Σωματείο διοικείται από 5μελές αιρετό Διοικητικό Συμβούλιο, που εκλέγεται από τη Γενική Συνέλευση των μελών του, η οποία έχει την ανώτατη εποπτεία του Σωματείου. Η θητεία του Διοικητικού Συμβουλίου καθώς και της Εξελεγκτικής Επιτροπής του Σωματείου, είναι τριετής.
Η συνολική λειτουργία του Σωματείου καθορίζεται από το Καταστατικό του.
Οι τομείς και οι παρεχόμενες υπηρεσίες καθορίζονται από την Άδεια Λειτουργίας του, ενώ οι διατάξεις των ειδικοτήτων του προσωπικού και κάθε άλλο λειτουργικό ζήτημα, προσδιορίζονται στον Εσωτερικό Κώδικα.
Η υψηλή εποπτεία της επιστημονικής εφαρμογής των προγραμμάτων εν γένει στο «Κέντρο», είναι αρμοδιότητα του (προβλεπόμενου από το Καταστατικό) Επιστημονικού Συμβουλίου, που απαρτίζεται από επιστήμονες διαφόρων ειδικοτήτων, της ημεδαπής και αλλοδαπής.